lo que te coemnte antes era para mp4 este formato da una buena calidad y con un tamaño no descomunal .
la resolucion que te decia era 360 x 640 , piensa que la mayor parte de la gente que vea el video no lo va a ver a pantalla completa , si no en la ventana pequeña que ofrece youtube .
pero si quieres probar con 1280 x 720 has una prueba pero no se si perderas algo de calidad por hir a una resolucion mayor de la del video inicial .
para que no te salgan los bordes laterales en negro has lo siguiente
donde esta el clip en la linea de tiempo vete al lado derecho del clip del video y donde hay un cuadrito pequeño (panoramisacion /recorte de evento) clikea en el ,y vete a (mantener relacion de aspecto) y ponle NO
Lo de pixel 1,0000 te comento que he hecho pruebas anteriormente y me daba mejor resultado esta que te digo , no me preguntes el motivo que hasta hay no llego.
correcto que hay que entrar en alguna plantilla ya hecha , tu simplemente cambia la configuracion y cuando la tengas hecha vas a la parte arriba del todo de esa ventanita y donde dice (plantilla) le cambias el nombre y guardas asi para otro dia podras abrir la misma plantilla que has hecho por ti .
y bueno espero haber resuelto algunas de tus dudas , ahora si te tengo que dejar que tengo que hacer las cosas cotidianas del hogar .

Gracias, lo probaré todo mañana y te cuento el resultado.

Bueno, pues despues de estar toda la tarde haciendo pruebas con lo que me dijiste ayer parece que empiezo a ver la luz al final del tunel 
Tengo aún alguna duda a ver cuento lo que hice y los resultados. He probado con relaciones de pixel de 1,000 y de 1,4568 (panorámico) cada uno me da un problema diferente, a ver si hay forma de solucionarlo...
El de 1,000 me crea un archivo mp4 que al reproducirlo tanto con el QickTime como con el reproductor de W Media Classic se me ven franjas negras arriba y abajo, por lo demás se ve bien. Curiosamente si marco la casilla que me dijiste que desmarcara "permitir a la fuente ajustar tamaño del fotograma" se ve correctamente en ambos reproductores sin franja alguna.
Con el de 1,4568 me crea un archivo mp4 que en el QickTime se me ve en 4:3 y curiosamente en el WMClassic se me ve en panorámico sin franja negra alguna.
Las preguntas son obvias:
1. lo dejo en 1,000 aunque salgan franjas negras en el reproductor o marco la casilla "permitir ajustar a la fuente" para que se vea a pantalla completa sin franjas?? lo pregunto porque me digiste que la desmarcara, no se los pros y contras o si afectará de alguna otra manera a la calidad final.
2. o por el contrario lo dejo en 1,4568 a pesar de que se vea mal en el reproductor Quick Time??  me preocupa el hecho de que no se vea bien en el QT aunque se vea  bien en el WMClassic, no se si será señal de que este archivo no vale para cualquier reporductor o es otro el problema.
Bueno, pues despues de lo andado a ver si consigo finalizar esta pesadilla    espero los últimos consejos  

dejalo en 1,000 , no obstante yo para ver videos en mi pc suelo usar el total video player y este reproductor te abre el video segun la resolucion que tengas el video .
por ejemplo si fuera un video de 360 x 640 el total video player lo abriria en la pantalla de mi pc a un tamaño como el que solemos ver en la previsualisacion de youtube ,pudiendo si queremos aumentar en tamaño a pantalla completa .
y si fuera un video de 1280 x 720 lo abriria a pantalla completa nada mas abrir el video .
pero aparte de todo esto , porque no renderisas un trozo de video de 10 segundos nada mas , de la forma que te comente anteriormente y lo subes a youtube para que veas resultados .

Perdona, se me olvidó comentarlo, sí que hice pruebas con un vídeo de 10s. casi 1000 jejeje, y coja la opción que coja de las que te dije en el anterior post es curioso pero en el reproductor de Youtube se ve igual, han desaparecido las bandas negras, lo que me preocupa es que el resultado no sea igual en calidad según la opción elegida, en esto tengo duda.
Bueno, entonces para concretar y quedarme ya tranquilo con mi proyecto, tu consejo es que lo deje a 1,000 aunque en el reproductor me salgan las bandas negras verdad?? como te dige las bandas desaparecen si marco la opción "permitir a la fuente ajustar tamaño de fotograma", aún así tu consejo es que no marque esta opción, es así??
Y una última cuestión, noto muy poca mejora en calidad de poner una velocidad de fotograma pequeña a una grande, sin embargo el tamaño del archivo aumenta considerablemente, mucho para la poca calidad que mejora, sabes a que puede ser debido?? tal vez sea la baja calidad de los vídeos grabados por mi cámara??
Gracias por todo.

bien , entonces el problema de las bandas esta solucionado . pero para el tema de calidad es relativo , todo  depende de que el video que estas subiendo este bien de calidad tambien . por lo del tema de bitatre o bit's la verdad que veo un poco excesivo la cantidad que le estas poniendo . a veces por mucho que le pongas no va a mejorar mas de lo que se podria y solo vas a conseguir tener un tamaño muy excesivo en el video .

Sí se solucionó el tema de las bandas en Youtube, pero pienso como tu, temo que la calidad del video de Youtube dependa del vídeo de origen, por eso te pedí en el anterior post que me confirmaras los parámetros, para conseguir un video original con una calidad aceptable para que mejore en la medida de lo posible la subida.
Contéstame a lo que te pregunté plis, para mi es de especial interés 

te puedo aseguarar que con esta cofiguracion que hemos hablado  no vas a mejorar mas el video , es como tu comentas la videocamara no da para mas ,para poder sacar una imagen 10 tendriamos que hablar de HD , el cual no es el caso .

Buscando mi respuesta la he encontrado en este topic. Gracias

OK, pues muchas gracias por todo, me alegro tambien de que haya servido para alguien más, empezaba a sentirme un bicho raro 

Por cierto, se me olvidó comentarlo, al final lo hice como aparece en el post pero con la resolución original de mis vídeos 720x576 y sí que lo admite Youtube. Salen unas pequeñísimas líneas horizontales arriba y abajo pero apenas apreciables.

Una duda que me acaba de surgir sobre la marcha...estoy haciendo pruebas con otros formatos a ver que tal queda en Youtube ya puestos salir de dudas y practicar.
La duda es si es importante que elija la plantilla o la extención de archivo que elija el escaneo se ponga siempre en "progresivo" o el resultado es similar con otro tipo de escaneos.

para el tipo de reenderizado que haces es preferible el progresivo, ya que el entrelazado quizas tenga inconveniente con algunos tipos de monitores

Leches, aclarame eso que sí que es interesante. El progresivo es desentrelazado??entonces los otros dos "preferencia arriba""preferencia abajo" son entrelazados?? no sabía eso, probé con todos los métodos y el resultado me parecía igual, lo que no tenía conocimiento que era el entrelazado, mi anterior editor lo ponía claro "filtro de desentrelazado". Confirmarmelo plis!!
Bueno, al final probando y probando opté por hacerlo en lugar de mp4 en MPEG-2, creo que me ha dado mejores resultados, subí un archivo de 350Mb a Youtube y este es el resultado, creo que de calidad no anda mal teniendo en cuenta que está grabado con una cámara vieja y sencilla. Dedicado a los que me habeis ayudado.
Longboarding SLEEPING WITH BHANGRA

Me respondo a mi mismo por si alguien está interesado en el hilo.
El modo progresivo es para desentrelazar y poder ver en cualquier pantalla de PC sin las líneas horizontales típicas.