Si YA tienes los archivos de vídeo y audio por separado m2v y mp2 sólo tienes que multiplexarlos en un único archivo MPEG. Mira este enlace:
https://videoedicion.org/manuales/tmpgenc/tmpgenc.htm#1.1.1%20Realizar%20un%20MPEG%20video+audio%20a%20partir%20de%20un
Por otro lado, los archivos que tu tienes, aunque se llamen .m2v son un MPEG completo vídeo más audio. Normalmente m2v es sólo vídeo y mp2 es sólo audio.
https://videoedicion.org/manuales/tmpgenc/tmpgenc.htm#1.1.1%20Realizar%20un%20MPEG%20video+audio%20a%20partir%20de%20un
Por otro lado, los archivos que tu tienes, aunque se llamen .m2v son un MPEG completo vídeo más audio. Normalmente m2v es sólo vídeo y mp2 es sólo audio.