Reconozco que existen muchos problemas de este tipo y no paro de leer cosas, sin embargo estoy tropezando con uno que lo he solucionado de forma primitiva, pero creo que tiene que ser mas sencillo, por eso necesito ayuda.
 Tengo un avi (Divx50), y funciona como tal de maravillas, pero al querer pasarlo a mpeg con el tmpgenc a los quince segundos se me queda el video pillado, solo el video el audio continua.. jejeje. El codec que tengo instalado es el divx5.0.2. Si quiero cambiarle el codec por ejemplo con el Easy Video Converter y convertirlo a xvid idem de lo mismo, a los quince segundo pillao. La solucion que tengo es quitar el divx5.0.2 e instalar el divx4, pero esto hace que el al pasar el tmpgenc el video se ve descolorido (acuarelado), jejeje. Pero entonces convierto con  el Easy Video Converter el avi (divx50) a divx4, y por fin luego con el tmpgenc consigo el mpeg sin problemas... todo solucionado....  ¿Alguna ayuda a esta martirizada forma de trabajar?

Instala el DivX 5.2.1