No se si esto es normal, el programa no me genera las carpetas como si hiciera un DVD5, sino que genera una imagen iso.
¿A los usuarios de este programa os pasa igual?

Así es, el por qué lo ignoro. Para crear el Blu ray, utiliza de nuevo el DVD Architect con la opción grabar proyecto anterior, o el Nero o cualquier otro programa "quemador". Si lo que quieres es conocer primero el resultado de tu montaje, te recomiendo utilices un disco regrabable, BD-RE. Sale un poco caro, pero es preferible eso a crear directamente un posavasos de 6 euros con el Blu ray BD-R.

De todas formas, si utilizas Vegas para la edición, y has renderizado tu proyecto en AVC y la plantilla Blu ray que corresponda a las características de tu video, te tiene que salir "niquelao".

Suerte