A ver si soy capaz de explicarme. Este problema yo lo he vivido al reproducir en la linea de tiempo una serie de fotos (tratadas previamente con Photoshop) del tamaño de 1 fotograma para conseguir una secuencia. Solucioné el problema EXPORTANDO de nuevo toda la secuencia como Windows Media y también como Dvix, IMPORTANDO luego el clip creado, había desaparecido ese molesto efecto y pude añadirlo a mi creación. Quizás si pruebas a exportar en otro formato, también a ti te funcione.
Espero ser de ayuda. Suerte.
Espero ser de ayuda. Suerte.