Bueno gracias a dios yo no he tenido que armar nunca ese Frankenstein, no solo tienes varios formatos sino también varias resoluciones y para colmo el trabajo final es distinto a todas las resoluciones.
Bueno no se qué opinaran los demás colegas pero lo que se me ocurre es que lo conviertas todo a esa última resolución que quieres al final, sabrás que los videos que son de baja resolución seguirán siéndolo y es posible que se vean peor.
Luego haz un proyecto con ese valor de resolución y al final expórtalo en h264 o blue ray según te convenga, si fuera en h264 debes seleccionar en que lo vas a reproducir en el stream compatibility
Bueno no se qué opinaran los demás colegas pero lo que se me ocurre es que lo conviertas todo a esa última resolución que quieres al final, sabrás que los videos que son de baja resolución seguirán siéndolo y es posible que se vean peor.
Luego haz un proyecto con ese valor de resolución y al final expórtalo en h264 o blue ray según te convenga, si fuera en h264 debes seleccionar en que lo vas a reproducir en el stream compatibility