Es verdad que a mi, en la version 6.0 no me funcionaba muy bien el titulador de Premiere y además la calidad del texto dejaba mucho que desear. Al final, aun a pesar de ser más trabajoso, lo hacía con Photoshop.

Normalmente basta con instalar el archivo ejecutable.

Para cambiar un extra por otro puedes hacerlo simplemente con Ifoedit y Ifoupdate.

A las malas, haztelo con el Photoshop, lo guardas en tga, lo importas en premiere y lo pones encima de la pista de video.

Como un clavo estaré a las 22:00. Echamos un brindis y luego los que se animen a seguir la juerga, nos podemos pegar una jartá a reir en un servidor del Enemy Territory  .

Con DVD Author puedes usar directamente los archivos VOB de tu DVD para hacer la autoría.

Vamos a ver, no saquemos las cosas de quicio. ¿Por qué razón iba a hacer un montaje semejante? ¿Qué interés podría tener, salvo el de entretenerse mientras planta un pino???
¿Realmente merecería la pena tanto esfuerzo (por hacer el montaje claro)

No, TMPG DVD-Author no soporta subtitulos.

Perder se pierde, pero lo que si vas a hacer es ganar, ganar tamaño del archivo. Por eso, no entiendo el porqué lo quieres pasar a ese tamaño.
Si lo quieres por poder hacer una autoría de DVD con el, puedes pasarlo a algun formato compatible con DVD de menor tamaño, por ejemplo mpg1 352x288 que perderás menos calidad (hay que agrandarlo menos) y ganarás menos peso.

¿Que quieres hacer en un DVD que no puedas hacer con Scenarist?  
Para modificar un DVD existente tienes otros programas tipo DVDReMake.

No, Scenarist es un programa de autoría. La tienes que hacer tu.

Eso lo puedes hacer con AE. Tendrás que usar mascaras rectangulares animadas y aplicarles a esas mascaras un efecto Blur.

Explica un poco mejor el efecto que quieres, o mejor aun, pon una captura si puedes.
En cuanto a los efectos del Premiere, dependen de la versión que tengas. Muchos efectos de los comentados en el foro son de Premiere Pro, y algunos de estos no están en 6.x.

El TMPGEnc DVDAuthor acepta VOB para hacer autorías de DVD.

Quitarlos no, pero si taparlos colocando una barra negra (por ejemplo) encima.