Con el fichero de video (m2v) y el de audio (wav) tienes que hacer la autoría del DVD. El programa que elijas (TMPGEnc DVD-Author, DVD Lab, etc) te aceptará estos ficheros (algunos te exigiran que los multiplexes, otros que se lo des asi) y te los transformará en la estructura que tienes que grabar con algun programa "quemador de DVDs".

Yo siempre exporto con ese método y siempre me ha ido muy bien, excepto alguna vez que puse clips a camara muy leeeenta, que me iba a saltos (a lo mejor es por eso si es en una escena muy lenta).
Si no, prueba a exportar un fragmento del proyecto (una de las partes que den problema) a avi y mira si el avi va bien, para saber en que paso esta el problema.

Con Ifoedit puedes extraer el video y audio de la pelicula, el video lo pasas a avi y lo puedes modificar. Lo vuelves a comprimir y con el mismo Ifoedit puedes volverlo a poner en su sitio sin modificar el resto de la estructura del DVD.
Si solo quieres cortar un fragmento puedes hacerlo con las MPGTools del TMPGEnc, si ya quieres editar con fundidos y demas, puedes probar a ver que tal te va tu programa de edicion con el mpg, pero en general se llevan mal, y en ese caso tendrias que pasarlo a avi para retocarlo.

Del error del Premiere Pro en si, no te puedo responder, pero te puedo dar una solucion alternativa. Puedes exportar a avi y usar un compresor externo tipo TMPGEnc para hacer la conversion a mpg2, y una vez con tu archivo de video comprimido hacer una autoría con algun programa especifico de autoria, como puede ser el TMPGEnc DVD-Author o DVD-Lab, que te generan una imagen en disco duro del DVD, que luego podras grabar en disco con el Nero.
Ah, y otro consejo, al precio que van los DVDs, usa regrabables siempre, y solo si funciona todo en el regrabable, haz la copia definitiva, a no ser que quieras hacerte un juego de posavasos de lujo...

El paso de estereo a dolby surround te lo hace ya el ampli-decodificador para que tengas la sensación de sonido envolvente. El manual creo que hace referencia a pasarlo a Dolby Digital 5.1 que realmente tiene 6 canales de audio independientes.
Muy bueno, por cierto.

Lisa, ojo con esos máximos de 9500 para el vídeo. Las especificaciones del DVD ponen com tope máximo 9800 k/s para video+audio, y si el audio lo tienes a 384 que suele ser habitual en audios 5.1, lo superas. Y aun no superándolo, no se recomienda pasar de 9000 en total, porque se puede atascar el reproductor (muchos "kas" a leer en un segundo).

Con la version 6.0 que es la que yo uso, si pulsas Alt a la vez que arrastras el cursor por la linea de tiempos verás la transicion (eso si, sin audio).

ENHORABUENA moderador (aunque de moderado no tiene mucho...).
Lo dicho, que nos moderes por el buen camino.

El Premiere para hacer las transiciones coge los fotogramas que hay por detras del final del primer clip y los que hay por delante del principio del segundo clip. Si alguno de los clips acaba o empieza justo donde quieres hacer la transicion puede pasar eso.

Y como homenaje a su labor en esta hermandad, coincidiendo con su nombramiento de MODERADOR GLOBAL le hacemos entrega del SIMBOLO DE PODER, codiciado por muchos y unicamente al alcance de unos pocos.....EL MOLINILLO UNICO, forjado en los fuegos del Monte Pinnacle, para que nos guíe por el tortuoso camino de la edicion y la autoria.

...un molinillo para gobernarlos a todos, un molinillo para encontrarlos a todos, un molinillo para atraerlos a todos y atarlos a las tinieblas...

Se me olvidaba lo del audio. Cuando importas en Combustion un video con audio, en la ventana de seleccion tienes que activar "Enable set as audio source".

En la pestaña Timeline puedes arrastrar de la barra amarilla que tiene tu proyecto para alargar o acortarlo...

La mayoria de las camaras DV domésticas no graban en verdadero 16:9 (insertan franjas negras o estiran la imagen) de manera que realmente es un formato 4:3.

Miralo en el librito de instrucciones, si lo tiene, ahí lo tiene que poner.

Asegurate de que tienes fotogramas por delante y por detras en los clips que forman la transicion.