Si no tienes la carpeta Plug ins dentro de donde se encuentra el ejecutable del programa, probablemente hayas bajado una versión incompleta.
Prueba bajar de aquí:
http://sourceforge.net/projects/virtualdubmod/files/VirtualDubMod/VirtualDubMod%201.5.10.2/VirtualDubMod_1_5_10_2_All_inclusive.zip/download
No olvides bajar esta actualización:
http://sourceforge.net/projects/virtualdubmod/files/VirtualDubMod%20bugfix_cvs/1.5.10.2%20build%202542/VirtualDubMod_1_5_10_2_b2542.zip/download
Los archivos de la actualización reemplázalos en la carpeta original.
Prueba bajar de aquí:
http://sourceforge.net/projects/virtualdubmod/files/VirtualDubMod/VirtualDubMod%201.5.10.2/VirtualDubMod_1_5_10_2_All_inclusive.zip/download
No olvides bajar esta actualización:
http://sourceforge.net/projects/virtualdubmod/files/VirtualDubMod%20bugfix_cvs/1.5.10.2%20build%202542/VirtualDubMod_1_5_10_2_b2542.zip/download
Los archivos de la actualización reemplázalos en la carpeta original.