Bueno, papa noel se ha portado bien conmigo y me ha traido un disco duro para dedicarlo exclusivamente a la edición.    

Sinteman, voy a darte mi muy personal manera de manejar esto de los archivos auxiliares en Pinnacle, lo que yo hago es crear en el disco duro que es solo para edicion una carpeta en la raiz que me recuerde de que es el video que voy a hacer. ejemplo:
D:\VIAJE CANCUN, y dentro de esta carpeta creo las siguientes:
D:\VIAJE CANCUN\VIDEOS, aqui pongo todos los clips directo de la camara
D:\VIAJE CANCUN\PROYECTOS, aqui grabo los proyectos por si son varios
D:\VIAJE CANCUN\AUXILIARES, aqui le indico al pinnacle que ponga los auxiliares
D:\VIAJE CANCUN\FINALES,aqui es donde grabo los videos ya editados
D:\VIAJE CANCUN\IMAGENES, aqui pongo fotos, logos, etc que se usen

De esta manera cuando termino la edicion puedo respaldar el directorio D:\VIAJE CANCUN y ahi esta todo lo necesario para modificar estos videos por si en un futuor quiero hacer cambios, solo los vuevo a poner en el disco duro y configuro el studio para que apunte a estos directorios, de esa manera no se revuelven, los auxiliares sobre todo con los de otros videos, en esa carpeta se graba por ejemplo cuando usas una imagen JPG, para el studio es un archivo auxiliar, en resumen yo creo y esperando la opinion de otros compañeros que estos archivos los pongas en el disco que es solo para edicion, o sea donde no esta el sistema operativo, para que a la hora de crear el video todo lo que ocupa este en el mismo disco.

Espero te sirva de algo

Los archivos auxiliares son aquellos que el programa de edicón "crea" durante el proceso de edición.

Por ejemplo. Si añades una transición cuantas con el vídeo A y el vídeo B, pero desde el último instante en que el vídeo A está "completo" hasta el primer instante en el que se muestra el vídeo B al completo ha habido una serie de fotogramas intermedios que antes no existían. Los has creado tú durante la edición. Más concretamente los ha creado el programa de edición. Si la transición dura un segundo, pues el programa ha tenido que crear un vídeo de un segundo con es transición. Es algo que se crea, que antes de editar no existía. Eso son los archivos auxiliares.

Muchas gracias NetMan por tus consejos. Como soy completamente nuevo con el Studio 8 voy a seguirlos al pie de la letra, hasta que no se demuestre lo contrario  

Tambien gracias a ti Videoed por explicarme detalladamente la función de dichos archivos.

Saludos.