Tengo un video mpeg2 al que necesito recodificar el audio sin tocar el video. Con los avi lo hacia con virtualdub, pero con MPEG no he encontrado con que hacerlo. Hay algun programa que me permita hacer esto?

TMPEGEnc permite desmultiplexar y multiplexar vídeo y audio.

Pero esta cuestión ya te la han resuelto, en un tema que has creado sobre lo mismo, usando Sony Vegas.
Saludos.

No se realmente que desees hacer pero,si ya tienes seprado audio y video carga el audio en Beehappy y codificalo al formato que desees...

si usas vegas pues es mas sencillo, desactiva la pista de video y renderiza solo el audio...

saludos...