Se podria crear un archivo .avi a partir de otro .avi y subutitulos? Es decir, tengo el video por un lado y los subtitulos por otro y quiero meter todo en uno. gracias

Te aseguro que es posible. 

Hay algunos soft que "estampan" el subtitulo sobre la imagen y queda así grabado.

Como inicio te sugiero que mires uno que se llama DVTIMESTAMP o algo así, se que funciona para insertar fecha y hora, tendrías que mirar si admite otro tipo de subtitulos.

Hay tambien soft mucho más complejos de edición y autoria que tambien lo pueden hacer, creo que trabajan con Croma-key ( ó algo así ) pero esto considero es mucho más complicado sin necesidad.

Los soft que son dedicados para el tema de inserción de subtitulos directamente son pequeños y superrapidos y faciles de usar.

Cualquier duda consulta.