Primera vez que uso After Effects, siguiendo un tutorial hice un texto con el efecto de animación de Trazo. 

Al exportarlo intenté renderizar como "animación QuickTime" y como "QuickTime PNG", ambos con RGB+Alpha. También probé con AVI y RGB+Alpha.
Cuando pego mi video en Vegas Pro 13, todavía tienen un fondo negro. Ninguna de las 3 formas en que lo hice, logré hacerlo funcionar.

Adjunto captura para corroborar que mis dos elementos, el texto y el trazo, estén correctamente y sin fondo. El trazo de pincel es de una imagen PNG.
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Vegas no reconoce de forma automática la transparencia alfa. Debes hacer clc derecho sobre el evento y en "Propiedades/Media/" verás "Canal Alfa" donde deberás elegir una de las tres opciones.

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