A ver si me puedo explicar, quiero hacer varios clip con los mismos efectos pero guardarlos en diferentes veg, hay alguna manera de que al hacer el primer clip, guardar de alguna manera la configuración de efectos para darselos todos automaticamente a los demas clip`s?

A ver si es lo que entiendo...

Inserta tu clip y agrega lo efectos que necesites.
Da click al lado derecho de los efectos (en la ventana de los mismos) al icono que dice Plug-In Chain.
Dentro de Plug-In Chain le das en guardar como, pones un nombre y listo.
En el Menú VER activas Plugin Manager y dentro de Video > FX > Filter Packages estarán los efectos.

Esos efectos estarán para que los uses en los proyectos que quieras.

Saludos.