Saludos, mira si estas renderizando para DVD Architect, en el formato MPEG2 para DVD, a mi me ha pasado eso, no tienes que renderizar el audio por separado, solo tienes que seguir estos dos pasos al momento de renderizar el proyecto. Los pegare aqui en dos PNG, es muy sencillo.

OJO,

esta informacion puede confundir a usuarios nuevos de Vegas.

Si se queire hacer la autoría con DVD Arch, SI es recomendable hacer renders de Audio y Video por separado.
Si se hace un solo render de AV, DVDA recomprimirá el audio.
Si quieres que DVD A lo haga, no tienes que complicarte entonces con marcar la casilla de audio en la plantilla de "DVD a....Video Stream". Puedes hacerlo escogiendo una plantilla de DVD NTSC o PAL segun sea el caso.
O incluso, llevar el AVI DV directamente a DVD A y hacer que éste hagas las compresiones del Video y el audio.
Pero repito, lo recomendable es hacer renders separados y ponerle al archivo AC3 de audio el mismo nombre que tiene el MPEG2 y guardarlo en la misma carpeta para que DVD A lo "importe" directamente al cargar el archivo de video.
saludos

Startel

Y abundando en el tema, si exportamos en mpeg layer II lo haremos en un formato comprimido que Architect volverá a recomprimir (todavía más). Nos quedará un audio pésimo. Si acaso queremos que Architect recomprima para no hacer renders separados desde Vegas, se debería exportar desde este en PCM.
 
X.