Es decir que quieres cargarlo en un editor de video para hacer algunos retoques? Si es asi no es recomendable codificar para tener un fichero soportado por tu programa de edicion, lo mejor es solo cambiar de contenedor como ya dijo profiler , el tsmuxer no edita, solo encapsula dentro de otros contenedores para acoplarse a la reproduccion o carga de videos
Saludos
Saludos