He utilizado Studio 9.4.3 durante más de un año, y siempre he codificado con CBR, para conseguir más calidad. No creo que sea ese el problema. Un proyecto largo y con muchos efectos es muy difícil de "digerir" para el Pinnacle. Al parecer tienes la máquina en perfectas condiciones (supongo que tienes los discos desfragmentados, etc.). Intenta hacer lo que dice nij: divide el proyecto en fragmentos más cortos, haz AVIs de máxima calidad y luego los unes en un proyecto final. Esto te servirá también para localizar un posible "punto negro" de edición, si los hay, y poder rehacerlo.
Saludos, y suerte,
Saludos, y suerte,