Parece que lo he solucionado. Había un parametro trasteable que no había visto: los fps en la exportación!!! un poco memo sí que he estao...
De todas maneras aunque los vídeos pierdan calidad tras pasar por AE he comprobado que al ser devueltos a premiere y después exportada la secuencia completa desde allí, la calidad se mantiene.
De todas maneras aunque los vídeos pierdan calidad tras pasar por AE he comprobado que al ser devueltos a premiere y después exportada la secuencia completa desde allí, la calidad se mantiene.