Lo pusiste progresivo.. bien.
Pero en lo de mas ¿que?
Que propiedades le diste???
Variando estas de puede ganar calidad, pero aumentando el tamaño.

Tienes sitios especializados en ello..
Ellos te preguntan unas cuantas cuestiones y a razon de ello te cobran.
Aqui tienes uno de ellos.
http://www.playkpm.com/?language=es

El proyecto de trabajo de Premiere ¿ tiene esas mismas caracteristicas ?
Quiero decir, tu proyecto de video esta puesto a 352 x 240 a 29.97 Fps???
Premiere 6.5 es una maravilla, pero los videos tienen que tener las propiedades del proyecto, de lo contrario.. a veces funcionan y otras no.
La solución estaria en pasar esos videos Mpeg a AVI con las medidas y framerate del proyecto final.
SUERTE

No todos los archivos VOB son iguales.
Y no por modificar la extensión se transforma el formato del video.
Que funciona a veces.. pues casualidades de la vida.
SUERTE

Cuando dices que puedes seleccionar entre 25 y 50 FPS, estas equivocado..
Se trata de 25 o 50 campos por segundo.
Es decir Progresivo 25 campos.
Y Entrelazado 50 campos.

No creo que nadie ponga tantas especificaciones, para que luego no se cumplan.
Cualquier PC de hoy dia, puede hacer eso y mucho mas.

Es decir, que el problema es siempre las ondulaciones.
Puede que la cinta o el reproductor esten un poco chungos
¿ los cables son buenos o muy finitos ?

Segun tengo entendido, las tarjetas Pinacle no trabajan con Premiere.
Pero puedes manejar el soft que trae la tarjeta para capturar.
Y luego editar en adobe o en cualquier otro.
SUERTE

Estoy leyendo mi propia respuesta.. y suena a que no quiero ayudarte mas.
Lo que quiero decir es, que si quieres una ayuda mas profunda, tendras que decirnos los detalles de cada paso que das.
Incluso mandar una sec de 1 seg, de la captura, otra del render y otra de una captura realizada con Matrox Digisuite.
Para poder analizarlas y darte una respuesta.
SUERTE

Sin comentarios..

Nunca estan de mas estas cosas.
Un dia pondre yo, las cosas que hecho de menos en Premiere Pro, que tenia el 6.5
SUERTE

Otra cosa que se puede hacer es : vincular las capas. (enlazar)
De esta manera las tienes por separado.

Estas intentando decir que:
Capturas por FireWire con Premiere CS3
Editas esas capturas y otras, para exportarlo con el codec de Matrox (el que sea)
Y luego inicias la version 6.0 de Premiere para exportar ese video con Matrox Digisuite.....
* No entiendo por que haces todo esto y no exportas otra vez por FireWire.
O por que no editas desde el principio con 6.0
Pero sin duda, el problema es que : El video generado por Premiere CS3, no tiene las propiedades que deberia..
Pero para poder ayudarte mas, tendrias que informar mucho mas a fondo.

Es lo que pasa con esto del texto.
Que algunas cosas se puede leer de distinta forma.
Pero la cervecita ... esa solo se toma de una forma.
SUERTE

Lo mismo me pasa a mi, que el ultimo fue el 8.
Hace mucho que no tengo un currito de Multimedia.
SUERTE