Ni idea, pero para reducir el tiempo que tarda el mkvtool tienes que guardar el destino en otro disco duro, para que no se lea y escriba sobre si mismo (cosa que retarda las cosas) Yo un MKV al agregarles cosas cuando los bajos, solo tarda a lo mucho 5 minutos por 3.5 - 4.5 gb de video

Fácil.... nadamas con VirtualDub Mod, solo al momento de guardar dale clic en "No correr, agregar a la lista de trabajo", y cierra y sigue con el siguiente video y así sucesivamente... al final vete a menú archivo, Job List

Pues hay 2 maneras:
*Usando el software de creación: Usar el Adobe Flash CSx... primero descomplila con algún programa el swf para exportarlo a FLA, después abre el FLA con el adobe y exportalo a AVI


*Grabación directa con programa de grabación de escritorio: Bajate el camtasai o camstudio y graba directamente sobre él...

Hola,  mira, youtube tiene varios tipod de video, 1 cuando se acaba de subir el video, y es "express" ya que es de mala calidad y pueda ser visualizado rápidamente.  Youtube sugiere los siguientes formatos:
Optimizar las subidas de tus videos

Formatos de archivo