He pasado una cinta de VHS con un DVD casero grabador y me ha generado una carpeta VIDEO-TS que contiene ficheros .vob y .bup. Para poder capturar con mi programa pinnacle he pasado este formato a .avi con el programa VirtualDubMod y se me ha generado un fichero avi que compruebo y se ve y se escucha perfectamente.

Intento editar este fichero en el pinnacle studio 9.4.3 y lo paso a la linea de imagen, la imagen se ve bien pero no tiene sonido. ¿alguien me puede ayudar?

Puedes probar de leer directamente los .vob con la opcion: Archivo -> Importar titulos de DVD
Te ahorrarias pasarlos a .avi y a lo mejor resuelves lo del audio.
Suerte y saludos