premiere ha avanzado mucho con el croma no se cual es tu idea en si, pero si grabasteis con un fondo verde o  azul para hacer la crominancia no es necesario pasar por el after, existe una carpeta que se llama Keys de efectos en premiere que simplifican el trabajo con una buena calidad, por que al trabajar un avi que es muy largo bueno la renderizacion se demorara resto, mira la carpeta de key y trabaja con ellas a ver como te trabaja