A mi me pasaba con la captura de analógico con la MovieBox Dv y lo he resuelto cambiando la resolución de captura de 720X526 que lo mete por defecto y lo he cambiado a 352xx288 que es suficiente para VHS y no me elimina ni un solo fotograma. Mi configuración es similar a la tuya.
Ha por supuesto he desconectado la vista previa. Espero que te sirva despues de probar se me ha resuelto así.