Pues esa es mi duda, ya que en las características del programa no se especifica esta posibilidad y hace un tiempo hice la consulta en una tienda Apple y me dijeron que si se podía.
Quizás en las nuevas actualizaciones de Final Cut se haya suprimido esta opción visto el poco éxito comercial del 3D, que incluso ha hecho suprimir los televisores con esta tecnología del mercado
Actualmente edito 3D en Sony Vegas, pero me gustaría explorar otras opciones

No sé si Final Cut edita 3D de forma nativa.
Recuerdo que había un plugin llamado Stereo3D Toolbox para Final Cut:
https://fxfactory.com/info/stereo3dtoolbox/

Pero por lo que veo han dejado de darle soporte.

Saludos.

Gracias por tu respuesta.
He confirmado a través del Servicio Técnico de Apple, que Final Cut no tiene soporte para la edición en 3D, así que seguiré con Vegas Pro . . . mientras dure

Alguien me ayuda con algo parecido?