Cuando metes VTS_01_2 en el TMPGEnc, ¿no te muestra nada o no te muestra el audio? Si te muestra el m2v pero no el ac3 puede ser porque el audio extraído del VTS_01_1 ya lleve el audio de TODA la película.

Nada, lo he vuelto a intentar, pero no.

Cuando meto el VTS_01_2, no me muestra ni la información del Vídeo ni la del Audio. Si hago doble click sobre los archivos, solo me deja guardarlos como "all files", y claro no me lo guarda como archivo de video ni el de audio como audio.

Eso solo me lo permite hacer en el VTS_01_1

Por qué será?

Vamos a ver, Javienigm, ¿qué quieres hacer con esos mpeg's? SI los vas a editar, usa DVD2AVI para pasarlo a un avi DV o MJPEG. La pérdida de calidad será MÍNIMA y luego no tendrás problemas con ningún programa de autoría.