AL INTENTAR UNIR ARCHIVOS MPEG CON TMPGENCODER ME QUITA DE LA LISTA ALGUNOS POR NO SER MPEG COMPATIBLES.
  COMO PUEDO HACERLOS COMPATIBLES?

    GRACIAS

HolaDanierl,

Podria ser que antes de unirlos debieras  recodificarlos al mismo formato mpg1(vcd) o mpg2 (dvd y svcd)
y tambien que tengan 25 frames (PAL) o 29 (ntsc). Lo puedes hacer con la misma herramienta que comentas.

Un saludo.aiandres