Tengo un video que la calidad no es muy buena, hay alguna manera de mejorar la calidad , ya sea comprimiendola con otro codec o otro formato

Hay un dicho que dice "De donde no hay, no se puede sacar".

Hablando claro, recomprimiendo no conseguirás más calidad, como mucho te quedarás igual.

Lo unico que puedes hacer es en todo caso aplicar algun filtro para eliminar ruido de la imagen (Temporal Smoother p ej). o alguno para corregir dominaste de color, brillo o contraste. Mejorará algo, pero no esperes milagros.

En fin lo mejor es que pruebes tu mismo.

PD: El virtualdub lleva una serie de filtros de serie que puedes usar, de todos modos se le pueden poner más; en esta página puedes ver algunos.
http://neuron2.net/