Tan fácil y tan escondido...

Abre WinAmp y pincha con el botón derecho. Ve a "Options -> Preferencies" (Opciones -> Preferencias)

En el apartado "Output" (salida) elige Nullsoft Disk Writer Plug-in. Con ese módulo podrás escribir en formato WAV los archivos de sonido que reproduzca Winamp (WAV, Mp2 y Mp3 entre otros) Como no sólo queremos escribir el archivo en WAV, sino que además queremos cambiar de frecuencia, pinchamos la casilla "Convert to format" (convertir al formato) y pinchando en el botón con "..." (ver flecha en la imágen) elegiremos el formato deseado



Dale a "reproducir" y tendrás el nuevo archivo en el directorio de destino que hayas seleccionado (por defecto c:\, en la imágen e:\Capturas Audio)

Así obtenemos un archivo wav a 48 kHz que tenemos que volver a comprimir a mp2 para poder usarlo en un programa de autoría. ¿No hay manera de convertir un archivo mp2 de 44.1 kHz a 48 kHz sin recomprimir?

Puedes hacerlo con TMPGEnc. En ese caso la conversión se hace automáticamente (por huevos has de pasar a WAV para cambiar la frecuencia)

Si le dices a TMGPENc que use TooLame y SSRC como compresor/conversor de frecuencias el resultado es excelente. Consulta este hilo:

https://videoedicion.org/manuales/tmpgenc/tmpgenc.htm#6.%20TMPGEnc%20como%20compresor%20de%20audio

He encontrado una aplicación gratuita, extremadamente sencilla y muy eficiente para convertir frecuencias de muestreo con archivos WAV:
r8brain v1.7