Increíble..... llevo dos días dando vueltas al tema y justo después de hacer la pregunta he encontrado la solució, La posteo por si sirve a alguien:


He cargado los videos en virtualdub y en el apartado "Video -> Frame Rate" he encontrado una opción que ajusta automáticamente el numero de fps para sincronizarlo con el audio:


en "source rate adjustment" seleccionar la tercera opción: "Change so video and duration match" 


Ha modificado el video de 25 fps a 21'794fps y con eso queda solucionado 

No sabía muy bien como resumirlo en el título, pero tengo un problema de sincronización con unos vídeos.


La cámara que los ha grabado genera archivos de vídeo de 20 minutos (tiempo real grabado) en los que la pista de audio dura 20 minutos y la de vídeo solo 17. La pista de vídeo se reproduce acelerada, a mayor numero de fps de los que está grabado, y progresivamente se va desfasando del audio. Cuando la reproducción del archivo llega al minuto 17, la pista de vídeo se acaba y la de audio sigue hasta el minuto 20.


La duda que quiero plantearos es ¿como puedo modificar la pista de vídeo para que se reproduzca en el tiempo real al que fue grabado y así poder sincronizarla con el audio?


Gracias de antemano por la ayuda!!