Lo primero de todo has de tener bastante claro el tema de hacer Copias de Seguridad de DVD - CD (ya sea Divx o VCD).
Si eso lo tienes claro (es decir ya has hecho varias pelis), lo unico que necesitas es el programa VOBSUB, que es el que te permitira unir los subtitulos y el video, aunke para ello necesitas tb el Virtualdub.
Pero el como se usa este programa es un poco extenso, asi que te pongo un link a una pagina n español donde se explica paso por paso como se hace

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http://usuarios.lycos.es/macdivx/index1.html (http://usuarios.lycos.es/macdivx/index1.html)
Ves a la sección manuales, manual de VOBSUB.
NOTA: ahi se explica como hacerlo usando el Gordianknot, pero basicamente el gordianknot lo que hace es usar el Virtualdub, asi que para usar el VOBSUB y unir lso subtitulos en el virtualdub, tendras que añadir el FILTRO que habrá instalado VOBSUB en el Virtualdub y te saldrán las mismas opciones para cargar los Subtitulos.