Bueno, no contaba con esto. En la página de Ac3Filter he visto que han creado un plugin que habilita al Audition para importar y exportar audio  ac3 (exporta en estereo).

Para descargar ambos programas (Ac3Filter y Audition plugin): http://ac3filter.net/

Ambos están en "Projects". Si no tienes la versión 1.46 de Ac3Filter hay que actualizar a esta. Despues de instalar el filtro hay que pegar ac3filter.flt en la carpeta de Audition.

Audition no carga el archivo de audio si es un VOB (desde "Import/Audio..."), no hacerlo desde Extraer audio de video. O sea, que si queremos importar audio desde un video DVD hay que separar el audio con VirtualDub Mod, por ejemplo. No he comprobado si puede directamente con algún avi y ac3. Tambien nos permite exportar a ac3 (estéreo) cualquier archivo de audio.

X.