Bueno días!! Os comento estoy trabajando en la realización de un reportaje de alrededor de 30 minutos con adobe premiere 5, capturo los videos a través de fireware conectado a un magnetoscopio que lee cintas dv que yo mismo grabo con mi cámara.
Se me presenta el siguiente problema; cuando capturo un clip de una duración superior a 3 minutos aproximadamente esos clips se me presentan con un descuadre del video y el audio cosa que me resulta muy incómoda ya que luego me toca cuadrarlos. No tengo gran entendimiento en conceptos tecnológicos pero os dare toda la información que necesiteis para resolver este problema. Os agradeceria que me dierais todas las posibibles causas de este problema que vosotros conozcais. Buenas tardes desde Elche.

Hola y bienvenido a videoedicion 
Prueba a capturar con un programa llamado DVIO. Puedes descargarlo desde aquí: http://www.carr-engineering.com/DVIO.exe

Manual:

   
• Conecta el magnetoscopio al ordenador
• Ejecuta DVIO pinchando dos veces sobre su icono (no necesita instalarse)
• Del menú, escoje el tipo de AVI que deseas, o sea, escoje AVI tipo 2
• Escribe el nombre que tendrá el archivo
• Click en "Capture"
• Pon a reproducir el magneto

Previamente deshabilita el antivirus y cualquier otro proceso que se esté ejecutando pero que no sea necesario en ese momento, como las descargas, reproducciones de vídeos etc.
Realiza una captura de prueba y luego reproduce el vídeo para ver si hay desfases entre el audio y el vídeo.

Saludos

muy amable maikel!!