Actualmente estoy usando AE CS3, y tengo gigas y gigas de templates, o  trabajos para editar, muchos solo vienen con animacion de texto con un  fondo plano negro, podria existir alguna manera de usar esa imagen  plana negra de fondo y poner otra cosa? que se yo, un video el cual  este trabajando o algo por el estilo? asi como para crear marcas de  agua o hacer de ese efecto un logo y colocarlo en una esquinita del  video? se puede hacer?

pd: los  templates que uso son esos que dicen PLEACE TEX HERE tengo como 200 de ellos.

[mod]Modificado el Asunto.[/mod]

Puedes probar a utilizar Efecto canal -> Definir mate -> Luminosidad y duplicar la capa por si pierdes detalles.

haz intentado, mediante los modos de fusion, combinando los distintos modos de fusion te sorprenderas de las cosas que puedes hacer.

 
No entiendo bien pero prueva con :

clave / croma lineal  y le das con el cuenta gotas sobre fondo del titulo o imagen superior .

algunos background tienen canal alfa, suelen ser precisamente para lo que quieres.
generalmente se ve gris.
si es asi, seleccionas el clip en la linea dwe tiempo boton der. propiedades ficha medios, y juega con el color alfa , si lo tiene, se hara transparente.
si no, como dice zocap, seleccionas el clip y le añades un efecto de video (croma keyer) seleccionas el color que quieres que sea transparente y vuala.
recuerda que el clip de texto (en tu caso) tiene que estan en linea superior al fondo (en otra linea)