una pequeña duda: ¿En que vas a reproducir un 9x16?

trabajo principalmente con dvd architect, pero aplica igual a encore.
Los botones no existen en dvd, lo que hay son zonas para click o funcion de boton, todo el video se aplana a una sola capa, lo que asignes de boton se convierte en una marca en una capa separada de color (circulo, linea, figura, etc.), lo que puede ocurrir dependiendo del reproductor es que haya un ligero parpadeo, algunos no lo hacen

con loop point decides donde quieres que vuelva a empezar el menu, yo tengo un menu con 10 segundos de introduccion, despues de ese tiempo es un loop, asi que reinicio en 10s
Menu timing and looping

para aligerar la edición podrías usar archivos proxy, estos llevaran un tiempo determinado para generar esas versiones compactas de los originales, pero al final la maquina debe de trabajar muchísimo si quieres hacer el render en 1080p al cambiar los proxy por los fullhd (sobrecalientamiento, pelear por el uso del disco con sistema, memoria virtual y archivos de proyecto)
no te recomiendo usar una notebook, te la vas a acabar muy rápido

varios factores darian ese resultado, bitrate demasiado alto, codificacion con intraframe, profundidad de bits...
checa las opciones de salida de la exportacion, ahorita no tengo nombres pero si el archivo es un ts(transport stream) bien podrias extraerlo con un demuxer y hacerle un multiplexado a mpeg(program stream) o mp4 segun sea el flujo del archivo .ts( las transmisiones pueden ser mpeg o h.264). para demuxear y multiplexar uso la utilidad integrada de tmpgenc 4 xpress pero hay otras, asi no recomprimes

intenta con avidemux abrir el .avi y guardarlo como mp4 con la opcion copy en video y aac en audio para que genere un mp4 sin recomprimir el flujo h.264

en menu tools no esta la opcion burn disc / dvd?

intenta cambiar el formato de video a otro con las mismas propiedades, un quicktime JPEG a 75% e importalo. los videos de xvid u divx son algo problemáticos por los codecs, a mi no me sale la pista de video de algunos de estos formatos

probablemente sea problema del codec, intentaste hacer conversión a otro formato desde algún conversor? si la entrada es mov, tienes actualizado quicktime?

las lineas horizontales son como el efecto de entrelazado?
si es asi, checa los ajustes de composicion de after effects y el modulo de salida que usaste coincida con el formato de entrada.
lo que te pregunto aparte es: para que usas after effects?

instalaste quicktime o el codec asociado al .mov que tienes?

seria mas visual si compartes alguna imagen o el projecto

algunos plugins se ponen especiales, lo que puedes hacer es hacer es hacer un prerender a un nuevo track o selectively prender video a la selección en calidad good o best según sea el render final, para que no vuelva a generar la transicion y use el cache de lo anterior mencionado

bueno, algo parecido me ha pasado con la transición Cross Effect, la use para imágenes de fondo de un menú, allí fue donde detecte que la transición se confundía y mostraba varias veces los cuadros de ambos clips1 del B, otro del B, como cuando escuchas un cd de audio rayado. lo tomo como un bug de memoria para no buscarle mas detalle, al final cierro vegas y lo vuelvo abrir y tan fresco como siempre, transición en buen estado. ese detalle lo puedo checar antes de hacer render, verificando que se vean bien las transiciones a sea en la calidad good o best según sea la que utilice de salida, no confíes en preview ni en draft ( al menos en vegas 11 )

no dices que versión de vegas, tampoco si lo aplicas como media fx o event fx....