Gracias por la respuesta pero esos ajustes solamente por lo que he podido probar afectan unicamente al momento de la transcodificacion que es el que esta haciendo correctamente.
Lo que no esta haciendo correctamente es crear los archivos m2ts a partir de los archivos transcodificados, cambiando el bitrate maximo de 20 a 48 en el archivo en el que multiplexa el audio y el video

He creado en encore cs6 un proyecto para generar un bluray. Lo configuro para H264 y un bitrate maximo de 20 mbps,

Al transcodificar los archivos he comprobado que el archivo AVC generado tiene un bitrate maximo de 20 mbps.

Al crear el bluray se generan los correspondientes archivos m2ts  pero con un bitrate maximo de 48 mbps.

Como puedo controlar que el bitrate maximo de los archivos m2ts coincida con el que he elegido?

[mod]Modificado el Asunto. Poner Problema no resume lo planteado en el mensaje.[/mod]