Eso "huele" a problemas de transferencia de disco duro. No es muy aconsejable que uses Win98. SI puedes pásate a 2000 o XP y usa particiones NTFS. En cualquier caso, lo primero que comprobaría es que tengas activado el modo UDMA del disco duro. No recuerdo exactamente donde está en Windows 98, así que tendrás que investigar un poco. Entra Inicio -> Panel de control -> Sistema -> Administrador de dispositivos -Busca ahí controlador de discos IDE, o directamente en los discos que te detecte (pincha con el derecho y ve a propiedades)
Estoy casi seguro que el UDMA es el "culpable" de tus problemas
Estoy casi seguro que el UDMA es el "culpable" de tus problemas

