al hacer pulldonw no cambia el tiempo del video, lo que posiblemente hay es un delay que en DVDLab se corrige con una herramienta... 

uhmm es posible que no ripeaste todo..
para verificar que contiene los demás audios carga el .m2ts en TSmuxer .y ve si en track aparecen los demás audios...
BDMV->STREAM-> .m2ts

aquí te lo envio, no olvidar colocarlo en la carpeta Plugins del VD..

mira este hilo a ver si te ayuda  ..   https://videoedicion.org/foro/index.php?topic=55282.msg295613#msg295613

claro especificas un intervalo en minutos ...en Automatically insert chapters with the selected interval...
http://www.mundodivx.com/autoriadvd/tda.php 

Hay dos que te pueden ayudar,  Mpg2cut2  y  MPEG2CUT funcionan de forma similar...
también Tmpgenc tiene en tools la opcion de cortar mpg..

definitivamente el audio dura lo que dura el render, puedes alargar el render y
editar el pequeño audio y que aparente un bucle para que no se escuche feo...

pd: es bueno que en el enlace del problema de DVDLab coloques la solución que
aplicaste y asi otro interesado en ayuda tenga conocimiento del resultado...

en esta guia puedes ver como dividir el video, luego creas un vcd con cada mitad...https://videoedicion.org/documentacion/index.php?article=40

a modo de prueba emplea otro video mpeg2 y compila, un video con error en el encabezado puede ser la causa.....
asi descarta,... si es por causas del video o del programa....   

hiciste lo que te aconseje? el error sale antes de todo al crear imagenes del menú,... es por eso que te sugiero  eso...un video con mal encabezado puede causar eso., pero si sera.....

claro no hay log porque ni empezo a compilar,.. parece problema del menú, quita el video (render) del menú y prueba... como no tiene audio ni hablar
ante todo te sugiero que tengas actualizado el programa....

en Project->Projects Properties->Options debe estar en Always Ask ...


puede  ser una de las causas como te indica Cieelo, una gran ayuda es leer el Log de la compilación truncada al menos te da la idea de donde proviene el error..... 

puedes colocar (copia y pega) el log que sale ..

en el proyecto hay algún archivo que has borrado? un archivo esta en el proyecto y no lo encuentra..