Creo que solo los funcionarios de Educación.

Trienios y sexenios.

Que no es poco, porque los manuales no crecen en los árboles. Alguien ha tenido que currarselos, y mucho, para que tú los tengas disponibles para aclarar tus dudas.

Prueba a usar otro compresor distinto del Adobe Media Encoder. Puedes exportar a avi, aunque te puede quedar un archivo gigantesco, para luego comprimir con TMPGEnc o Procoder. También puedes usar un frameserver para evitar el paso por avi.
El Debugmode Frameserver es compatible con la versión 1.5, aunque nunca lo he probado.

Muy bonita la del ala del avión.
¿Donde es la del glaciar?.

Pues captura en avi y luego comprime a (S)VCD con otro compresor tipo TMPGEnc.

Prueba a desactivar la Compatibilidad del Nero, probablemente los lectores de salon los reproduzcan sin problemas (a menos que las diferencias sean gordas).

¿Pero unos dummys de unos pocos segundos, como pueden "rellenar" tanto espacio?

Pues me temo que no es posible, si hace loop del video, lo hará inevitablemente del audio. Para evitar saltos en el audio, tendrás que currarte el audio de manera que en punto en que haga loop no se note (ya lo sé, es muy dificil).

Para que un archivo mpg2 sea compatible con el estandar de DVD tiene que cumplir unos requisitos, entre ellos que el tamaño de un GOP sea inferior a 15 cuadros.
Si no lo cumple, el programa de autoría no te lo aceptará.
¿Solución? Tendrás que recodificar el mpg para que lo cumpla.
Alguna vez con un mpg que no me aceptaba Scenarist por ese motivo, DVDLab Pro si que me lo ha aceptado, prueba a ver.

Eso se llama Overscan y se debe a que todas las televisiones recortan en mayor o menor medida la imagen, y no tiene solución. Procura no apurar mucho los bordes del fotograma para no perder cosas importantes.

Y también depende de que ese CVCD sea un XVCD o un XSVCD. El último se basa en compresión mpg2 y por tanto dará más calidad.
De todos modos, como la calidad es bastante subjetiva, sobre todo en casos con pequeñas diferencias, lo mejor es probar con un fragmento corto y comparar.

O también puedes usar el TMPGEnc para el audio, pero con un compresor externo mejor, como el Toolame.
En Option, Environmental Setting, en la pestaña External Tool, puedes poner la ruta del TooLame y el audio se comprimirá con este programilla que se supone mejor para audio que el mismo TMPGEnc.

Pues si es por poner, haberlo puesto en el Google, que a mi me han salido unos pocos sitios...