Podias ponerlo en rapidshare y miro a ver que pasa..
Por que a mi me funciona con todos los mpg

Eso pasa por que la televisión quiere mostrar los dos campos.
Para que no pase eso, des entrelaza el frame con Photoshop u otro programa.

Pues no tendría por que pasar eso.
Comprueba que están bien grabados.
Pon el vídeo y el audio y compruébalo antes de capturar.
Lo digo por que puede pasar, que el Minidisc este defectuoso.
De todos modos, puedes variar la velocidad del video o del audio, para que coincidan.

Es la primera vez que escucho (leo) algo así..
Una capturadora de doble entrada!!!!!!
Capturar a la vez e interlazar estos videos!!!!!!!!!
No comprendo que quieres hacer.
Si puedes explicarte un poco mas, quizás pueda ayudarte

Eso son los campos (el entrelazado)
¿para que es el vídeo? para verlo en la tele o en PC.

Seguramente que se trata del propio vídeo, estará defectuoso.
Mira en el previo, sin capturar.. si se ve mal, no creo que puedas hacer nada.
A no ser que quieras re escalarlo, para quitar los lados defectuosos.

Si se trata de realizar un programa con varias cámara en linea, necesitaras Hardware.
Si por el contrario se trata de grabar con varias cámaras, para luego editar un vídeo..
en ese caso, tal como dice gentedelplaneta, con un sonido agudo y corto es suficiente para sincronizar en la edición.

Para manejar desde premiere el mejor, creo yo es Agedfilm

Lo mas facil es restaurar Windows..
Seguro que se arregla...

Como bien dice Kuera, es recomendable editar en formato Avi DV..
por lo menos con Premiere.
Pero si la fuente de vídeo es Mpeg, mejor trabajar con otro programa que este mas preparado para trabajar con Mpeg.
Como es el caso de Vegas.
Puesto que pasar el Mpeg a Avi DV , es perder el tiempo y no ganar nada.
Pero esto es una opinión muy personal.
En el caso de que tengas comprado Premiere y quieres trabajar con el, tendrias que ver la forma de transferir los vídeos en formato DV.
Antes de comprar la cámara tendrías que haber pensado en ello.
Esto no es una bronca, es un consejo tardío...

¿de que premiere se trata?

Aqui tienen una foto...

Cuando se añade un video al menú, Encore necesita renderizar para mostrar el previo.
Esto lo hace pulsando en el botón (inferior izquierdo)

Yo por supuesto tengo que defender a la familia Adobe.
Premiere, After, Encore, Photoshop, etc...

Gracias Producciones..