Hola!
Nuevamente aqui con problemas

Un poco de historia:
Tengo 11 archivos de audio (WAV) al cual le quiero colocar video (uno para cada uno)
Los videos los tengo listo, y tienen estas caracteristicas:

CitarGeneral
Complete name                    : C:\Documents and Settings\Administrador\Escritorio\Video\Dino.avi
Format                           : AVI
Format/Info                      : Audio Video Interleave
File size                        : 6.21 MiB
Duration                         : 25s 33ms
Overall bit rate                 : 2 080 Kbps

Video
ID                               : 0
Format                           : MPEG-4 Visual
Format profile                   : Advanced Simple@L5
Format settings, BVOP            : 2
Format settings, QPel            : No
Format settings, GMC             : No warppoints
Format settings, Matrix          : Default (H.263)
Muxing mode                      : Packed bitstream
Codec ID                         : XVID
Codec ID/Hint                    : XviD
Duration                         : 25s 33ms
Bit rate                         : 2 054 Kbps
Width                            : 1 280 pixels
Height                           : 720 pixels
Display aspect ratio             : 16:9
Frame rate                       : 30.000 fps
Original frame rate              : 25.000 fps
Color space                      : YUV
Chroma subsampling               : 4:2:0
Bit depth                        : 8 bits
Scan type                        : Progressive
Compression mode                 : Lossy
Bits/(Pixel*Frame)               : 0.074
Stream size                      : 6.13 MiB (99%)
Writing library                  : XviD 64

Luego, compile el audio y el video en MKV, asi por 11 veces (quedando 11 videos con audio)
Todo perfecto, luego junte los 11 MKV en un solo archivo MKV para que sea una reproduccion continua. Tambien le coloque subtitulos, quedando asi:

CitarGeneral
Unique ID                        : 171663822949036471006756196632683758749 (0x81253FEC3E927A4EA88BB409682E449D)
Complete name                    : C:\Documents and Settings\Administrador\Escritorio\Video.mkv
Format                           : Matroska
File size                        : 76.4 MiB
Duration                         : 3mn 24s
Overall bit rate                 : 3 127 Kbps
Encoded date                     : UTC 2011-07-01 23:27:50
Writing application              : mkvmerge v4.7.0 ('Just Like You Imagined') creado el Apr 21 2011 01:13:14
Writing library                  : libebml v1.2.0 + libmatroska v1.1.0
Attachment                       : Fuente

Video
ID                               : 2
Format                           : MPEG-4 Visual
Format profile                   : Advanced Simple@L5
Format settings, BVOP            : Yes
Format settings, QPel            : No
Format settings, GMC             : No warppoints
Format settings, Matrix          : Default (H.263)
Codec ID                         : XVID
Codec ID/Hint                    : XviD
Duration                         : 3mn 24s
Bit rate                         : 2 936 Kbps
Width                            : 1 280 pixels
Height                           : 720 pixels
Display aspect ratio             : 16:9
Frame rate                       : 30.000 fps
Original frame rate              : 25.000 fps
Color space                      : YUV
Chroma subsampling               : 4:2:0
Bit depth                        : 8 bits
Scan type                        : Progressive
Compression mode                 : Lossy
Bits/(Pixel*Frame)               : 0.106
Stream size                      : 71.7 MiB (94%)
Writing library                  : XviD 64

Audio
ID                               : 3
Format                           : MPEG Audio
Format version                   : Version 1
Format profile                   : Layer 3
Muxing mode                      : Header stripping
Codec ID                         : A_MPEG/L3
Codec ID/Hint                    : MP3
Duration                         : 15s 934ms  <--------- ?
Bit rate mode                    : Constant
Bit rate                         : 128 Kbps
Channel(s)                       : 2 channels
Sampling rate                    : 44.1 KHz
Compression mode                 : Lossy
Stream size                      : 249 KiB (0%)
Writing library                  : LAME3.98
Encoding settings                : -m s -V 4 -q 3 -lowpass 17 -b 128
Language                         : English

Text
ID                               : 1
Format                           : ASS
Codec ID                         : S_TEXT/ASS
Codec ID/Info                    : Advanced Sub Station Alpha
Compression mode                 : Lossless
Language                         : Spanish

Y me quedo perfecto, nunca pense que seria tan facil y rapido (segundos)
Pero llego el problema.. al subirlo a una web de reproduccion de video (Facebook), no me toma los subtitulos.
Entonces pense pasar este MKV final a AVI, pero dando aun mas problemas, el audio se desincronizaba, dando saltos y sonidos extraños y el subtitulo se retrasaba.

Que me recomiendan hacer?

Tengo una idea de que la linea:

CitarFrame rate                       : 30.000 fps
Original frame rate              : 25.000 fps

Es la que da problemas?

Tambien pensaba en colocar los 11 videos, 11 audios y el subtitulo en un script de Avisynth para Virtualdub, pero nose el comando para armar..

Gracias! 

Holas.
No encontre solucion a esto, pero rehice los 11 videos pero a 25.000 fps

CitarGeneral
Complete name                    : C:\Documents and Settings\Administrador\Escritorio\Video\Dino.avi
Format                           : AVI
Format/Info                      : Audio Video Interleave
File size                        : 5.68 MiB
Duration                         : 24s 720ms
Overall bit rate                 : 1 927 Kbps

Video
ID                               : 0
Format                           : MPEG-4 Visual
Format profile                   : Advanced Simple@L5
Format settings, BVOP            : 2
Format settings, QPel            : No
Format settings, GMC             : No warppoints
Format settings, Matrix          : Default (H.263)
Muxing mode                      : Packed bitstream
Codec ID                         : XVID
Codec ID/Hint                    : XviD
Duration                         : 24s 720ms
Bit rate                         : 1 901 Kbps
Width                            : 1 280 pixels
Height                           : 720 pixels
Display aspect ratio             : 16:9
Frame rate                       : 25.000 fps
Color space                      : YUV
Chroma subsampling               : 4:2:0
Bit depth                        : 8 bits
Scan type                        : Progressive
Compression mode                 : Lossy
Bits/(Pixel*Frame)               : 0.083
Stream size                      : 5.60 MiB (99%)
Writing library                  : XviD 64

Y asi no se desincroniza.

Gracias por la ayuda 

Gracias por publicar la solución, seguro que a más de uno nos será de utilidad.
Saludos.