Me parece que te estás haciendo un lio con lo que lees por el foro.
¿Por que no lo hace por el camino fácil?. Captura todo junto, edita todo junto, y graba todo junto.
Cuando cojas experiencia, y domines muchos conceptos necesarios, te puedes meter en virguerías.
Pero ya que tienes hecha la captura, continua haciéndolo fácil.
Carga el vídeo en magix, en otra pista carga el audio y le das exportar en avi dv con sonido.
También probaría ha exportar en MPG? directamente con magix.
Para ahorrar tiempos de pruebas, cuando tengas video y audio en el time line, corta el final de los clips, dejando solo unos minutos, cuando las pruebas salgan bie, lo haces completo.
Y hablando de ahorrar tiempo, hazle caso a la recomendación de Tony, pásate por la sección de manuales y los estudias, ademas de leerlos, al menos los básicos, perderás bastante tiempo leyendo, pero luego ganarás muchisimo mas cuando pongas en practica lo aprendido.
Saludos.